前提として、クリア後なのでOSチューニングは全て適用済とする。
明らかに効率の良いミッションは無いので、効率が高めないくつかのミッションから、得意なものを選ぶのがよいだろう。
備考：1000 = 1k で表現

• 武装採掘艦護衛
  ３周目から選択可能なミッション。
  出てくる相手は全て爆発/燃焼属性に弱いため対策は簡単で、
  両手両肩にミサイル、両手に火炎放射器、両手両肩にバズーカといったアセンブルならば安定して周回可能。
  両手両肩ミサイル装備で試した所、「出撃」ボタンを押してから、リザルト画面まで約2分30秒で458kの利益、１分換算183k
• 特務機体撃破
  上の方でも紹介されているが、OSチューニング有りで他と比較用に記載。
  近接武器を主体にゴリ押しした結果、約2分で284kの利益、１分換算142k
• 地中探査 深度1
  十分な装甲と盾があれば回避せずに落下出来るので、お手軽に稼げる。
  約2分40秒で236kの利益、1分換算89k
• レッドガン部隊迎撃
  基本報酬が高い上に、撃破報酬も加算されるため、実質的な報酬額は全ミッションでも最上位。
  とはいえ大量のMTに加えACも1機倒す必要があるため、時間がかかる。
  MT相手に有利なEN属性で装備を固めて出撃したところ、約6分で632kの利益、1分換算105k
• ヴェスパー3排除
  ACを1体倒すだけなので楽。しかも相手は4脚でふわふわ浮いているのでミサイルがよく刺さる。
  全身ミサイルな装備で挑んだところ、約2分で293kの利益、1分換算で147k
• 企業勢力迎撃
  レッドガン部隊迎撃と同じく、基本報酬がそれなりの金額に加えて、撃破報酬もあるため高額報酬になる。
  撃破必須な相手だけでも、LC（ふわふわ飛ぶ方）１体（22k）、HC新型機体１体（50k）、バリア持ち汎用兵器２体（6.4k）、LC（砲撃）２体（64k）、AC１体（180k）と、322.4k加算され、基本報酬440kと合わせると１周700kの利益は見込める。
  両手RANSETSU、両肩３連プラズマミサイルで試したところ、約5分強で774Kの利益、1分換算で約151K
• 封鎖衛星阻止
  ラスボスを１体撃破するだけなのでミッション構成は楽だが、相手がよく動くしバリアも貼るためクリア時間は安定しない。
  両手両肩ミサイル装備で試した所、約3分30秒で466kの利益、１分換算133k
  近接武器を主に試した所、約2分で505Kの利益、１分換算252.5k（安定しない）
• コーラルリリース
  ３周目ラストミッションなだけあり、報酬が大きい。
  相手はこちらの射撃に反応して適宜回避するため、ミサイルで攻めると比較的楽に周回出来る、か。
  両手両肩ミサイル装備で試した所、約3分40秒で577kの利益、１分換算157k
  近接武器を主に試した所、約2分強で約604k、1分換算287k（安定しない）